根据发表在《蛋白质组研究杂志》上的一项新研究，深入研究在小鼠模型中生长的人类肿瘤的蛋白质和蛋白质活性，扩大了治疗髓母细胞瘤的潜在治疗途径。
作为研究的一部分，转化基因组学研究所 (TGen)、希望之城的一部分、Sanford Burnham Prebys 医学发现研究所和加利福尼亚大学圣地亚哥分校的研究人员之间的合作提供了为什么药物放线菌素 D 的机械解释基于先前药物筛选研究的结果，可能是治疗第 3 组髓母细胞瘤的有用候选者。
髓母细胞瘤是最常见的小儿恶性脑肿瘤，有四种主要的分子亚型。第 3 组肿瘤预后不良，5 年生存率为 50%。研究人员指出，对于所有髓母细胞瘤，迫切需要更有效的治疗方法和毒性副作用较小的治疗方法。
为了寻找新的治疗目标，TGen 博士后研究员 Kristin Leskoske 博士 和她的同事研究了从 20 名患有不同疾病亚型的髓母细胞瘤患者的细胞中生长的肿瘤。由此产生的肿瘤被称为原位患者来源的异种移植物或 PDX 模型。
“关于髓母细胞瘤的 PDX 模型是否足够接近用于研究和药物测试的原发性人类肿瘤，该领域存在一些争论，”TGen 副教授、转化质量协作中心主任 Patrick Pirrette 博士说光谱学，论文的资深作者。
他补充说，这项研究的一个重要结论是“从蛋白质组学的角度来看，这些 PDX 肿瘤与实际的患者肿瘤非常相似，可以用作该疾病的模型。”
细胞直接在小鼠大脑中生长，而不是像有时那样在实验室的培养皿中或作为植入物植入小鼠侧腹，“更接近地模拟肿瘤通常生长的环境，”该论文的 Leskoske 博士说。第一作者。
然后，研究人员深入分析了髓母细胞瘤蛋白质组，测量了每个 PDX 模型中每种蛋白质的含量，并确定了蛋白质的化学修饰，称为磷酸化，表明蛋白质的活性水平。
使用这些蛋白质谱，Leskoske 博士及其同事能够将某些蛋白质的丰度或活性与其对特定药物的敏感性相关联。例如，Sanford Burnham Prebys 医学发现研究所的合著者 Robert J. Wechsler-Reya 博士先前的一项研究表明，第 3 组髓母细胞瘤对放线菌素 D 敏感，但这种敏感性的原因尚不清楚。
“药物筛选确定了漏洞;他们没有确定它们的作用机制。我们的补充蛋白质组学研究提出了放线菌素 D 敏感性的潜在机制，”皮罗特博士说。
第 3 组髓母细胞瘤最常见的分子特征是 MYC 的扩增。在这项研究中，研究人员发现放线菌素 D 敏感性与 MYC 和 MYC 靶向基因的丰度增加之间存在显着关联。
研究中对放线菌素 D 敏感的许多蛋白质是线粒体蛋白质，它们是调节细胞代谢的关键。Pirrette 博士说，该团队还有其他未发表的数据，结合这些发现，表明某些代谢脆弱性可能针对第 3 组肿瘤。
Wechsler-Reya 博士说：“MYC 在髓母细胞瘤以外的其他癌症中也是一种众所周知的癌蛋白。”目前的研究结果应该鼓励我们寻找在这些 MYC 驱动的癌症中抑制线粒体功能的方法。 "